يضم متحف الآثار بمكتبة الإسكندرية قسم للآثار المصرية القديمة؛ والذي يضم قطعًا أثريةً تركز على الجانب الثقافي لتلك الحضارة، وتبرز أيضًا الناحية الفنية التي برع فيها المصريون القدماء.
يحتوي المتحف أيضًا على مقتنيات أثرية تعكس تاريخ مصر المتعدد الثقافات
ويتميز المتحف بكونه متحفاً شاملاً يعكس هوية مصر كملتقى للحضارات؛ حيث تحتضن أروقته مقتنيات أثرية نادرة تغطي العصور التاريخية المتعاقبة:
العصر الفرعوني: عظمة البناء وفنون النحت.
العصرين اليوناني والروماني: امتزاج الفن الكلاسيكي بالروح المصرية.
العصر القبطي: روعة المنسوجات والأيقونات الفنية.
العصر الإسلامي: دقة الزخارف والهندسة الإسلامية الفريدة.
